Karens Mølle var et seks etagers havnepakhus fra 1890, opført på Aarhus Havn langs Skolebakken på Pakhuskajen.

Bygningen, der siden fungerede som kornpakhus, blev senere omtalt under navnet Karens Mølle indtil denne brændte 27.- 29. september 1961 og efterfølgende blev nedrevet.

Bygningen var ejet af Aarhus Havn, og havde flere lejere, heriblandt en virksomhed med egne foderblandinger opkaldt efter stifterens datter Karen. Derfor kom bygningen i daglig tale til at hedde "Karens Mølle".