Magistratens 5. afdeling blev oprettet i 1950. Afdelingen holdt til på Spanien 19 indtil 1990, hvor de flyttede til Bautavej 1, 8210 Aarhus V.

Til magistratens 5. afdeling hørte:

* Aarhus Belysningsvæsen

* Aarhus Kommunes Vandforsyning

* Aarhus Sporveje

*Aarhus Offentlige Slagtehus og Kvægtorv.

De forskellige dele havde tidligere hørt under betegnelsen "Værkerne".

Aarhus Belysningsvæsen blev i 1962 lagt sammen med Aarhus Vandforsyning under navnet Aarhus Kommunale Værker.

Levnedsmiddel- og miljøtilsynet i Aarhus kom fra 1978 også under Magistratens 5 afdeling. Lufthavne og flyvepladser, henholdsvis Kirstinesminde Flyveplads og Tirstrup Lufthavn, kom under Magistratens 5. afdeling. Fra 1990 var det kun Tirstrup Lufthavn der lå under afdelingen, den gik nu under navnet Aarhus-Tirstrup Lufthavn. I

Aarhus Offentlige Slagtehus og Kvægtorv blev i 1999 omdannet til et aktieselskab med navnet Aarhus Slagtehus A/S og blev derfor en selvstændig virksomhed.

Fra 2002 dækkede Magistrenes 5. afdeling over Aarhus Kommunale Værker, Aarhus Sporveje og Skatteforvaltningen i Aarhus. Skatteforvaltningen havde tidligere hørt under Magistratens 1. afdeling.

Fra kommunalreformen i 2007 blev de funktioner Magistratens 5. afdeling havde haft lagt ind under Teknik og Miljø.