Første del af Skejby Sygehus blev taget i brug i 1987. Siden er der gradvis blevet flyttet flere afdelinger fra de andre Aarhus hospitaler til Skjeby. I 2011 fusionerede Århus Universitetshospital, Skejby og Århus Universitetshospital, Århus Sygehus til Aarhus Universitetshospital.

I 2009 blev det første spadestik taget til Det Nye Universitetshospital (DNU) på Skejby Mark. De første bygninger blev taget i brug i 2015, mens resten står færdigt i 2019. DNU-projektet har i korte træk til formål at samle alle afdelinger af Aarhus Universitetshospital under ét tag til det. Byggeriet gør hospitalet til det største i Nordeuropa, når det står færdigt.