I september 1961 blev Viby Statsungdomshjem taget i brug som pigehjem for 16 til 21-årige unge piger. Nye bygninger var opført på Bøgeskov Høvej til formålet. Beliggenheden er forblevet den samme, men adressen ændrede sig undervejs og er som i dag: Grøndalsvej 65. De første fire piger var overflyttet fra Vejstrup statsungdomshjem på Fyn. I slutningen af 1960'erne var det Socialstyrelsens vurdering, at behovet var ændret, hvorfor Bøgholt blev omdannet til et behandlingshjem for unge mænd og kvinder, fortrinsvis med stofproblemer.

I foråret 1974 besluttede Socialstyrelsen, at Bøgholt skulle løse nye opgaver - nemlig at være behandlingshjem for piger og drenge i alderen 12 til 16 år. Husene byggedes om og har op til i dag gennemgået ændringer for at modsvare den pædagogiske udvikling. I efteråret 1990 udbyggedes skolen med en pavillon for at forbedre undervisningsforholdene. Bøgholt i dag består af selvstændigt beliggende bygninger med elevafdelinger, administration, køkken, skole og undervisningsværksteder placeret på et stort grønt område, som er bevaret trods byudviklingen. Området er udlagt som parkanlæg, sportspladser, friluftssvømmebad og gartneri, ligesom der er en lille skov. Fra stat til amt - og til kommune: I 1976 overgik Bøgholt fra at være en statsinstitution til at blive amtsinstitution, med Århus Amt som driftsherre. I forbindelse med amternes nedlæggelse i 2007 overtog Aarhus Kommune Bøgholt.