Deltog i krigen i 1864 under militærets musikkorps. Da hustruen samtidigt opholdt sig i København, tyder det på, at Greffel deltog i krigen på dansk side.

Omkring 1866 kom parret til Aarhus, da F.B. Greffel blev tilknyttet 3. Dragonregiment. Familien tog først bolig i Vestergade 35 - senere i Frederiksgade 34.

Greffels tid i Aarhus var mest præget af afholdelse af koncerter på byens forlystelsesetablissementer såsom pavillonerne i Vennelystparken og Riis Skov. Netop ved Vennelyst stod Greffel i mange år i spidsen som dirigent for orkestret.