Vagn Særkjær var medlem af Aarhus Byråd fra 1. april 1974 til 31. december 1989 og udtrådt af Socialdemokratiet 31. marts 1986.

Vagn Særkjær var desuden medlem af Udvalget for økonomiske og administrative anliggender 1974-89, Udvalget for tekniske anliggender 1978-1985, Udvalget for kulturelle anliggender 1986-1990 og Udvalg for fast ejendom og grønne områder m.m. 1982-1985.